Problem może być jedynie ze skinami. Jest to związane z nowymi opcjami i okienkami jakie pojawią się w grze. Nie oznacza to jednak, iż tworzenie skórek do FM 2006 rozpocząć będzie trzeba od nowa. Wystarczy, jak twórcy danych skinów naniosą na nie odpowiednie poprawki. Ostateczne informacje na ten temat poznamy oczywiście dopiero po ukończeniu gry. Niespodzianek być jednak nie powinno.