Głównym elementem do poprawienia jest oczywiście AI piłkarzy, które to po za implantowaniu trybu 2D podlega znacznie bardziej szczegółowej analizie i ocenie przez fanów managera SI. W ostatnim czasie mocno oberwało się bramkarzom. Zdaniem sporej części fanów zbyt często popełniają oni kuriozalne błędy w postaci goli samobójczych, czy np. podając piłkę wprost pod nogi napierającego na nich napastnika. Na szczęście problem dostrzegają również twórcy gry. Odpowiedzialny za ten element gry Paul Collyer obiecał, iż owy element gry zostanie poddany szczegółowym testom i jeżeli wykażą one jakieś anomalie w FM 2006 zostaną wprowadzone odpowiednie poprawki.