SI Games stara się wprowadzać nowinki do każdej kolejnej wersji gry. W FM 2006 jedną z nich był właśnie kontrakt dla menadżera, który, jak to większość eFeMowych nowości, nie działa dokładnie tak jak powinien. Chodzi głównie o to, że kiedy na samym początku gry, będąc nikomu nieznanym trenerem, podpisujemy umowę z zespołem ze środka tabeli, to zdarza się, że zarabiamy więcej niż menadżerowie czołowych klubów tej ligi. Na pewno w żaden sposób nie wpływa to na naszą rozgrywkę, jednak może trochę denerwować. Niestety ten błąd nie został poprawiony w najnowszym patchu, gdyż- jak mówią pracownicy SI Tower- mieli ważniejsze sprawy na których musieli się bardziej skoncentrować przy wydaniu tej łatki. Na szczęście ten bug nie przeszkadza nam w grze i bez problemów możemy kontynuować rozgrywkę nie oglądając się na nasz kontrakt.