Wiele było zastrzeżeń w poprzednich wersjach Managera dotyczących systemu, według którego program wykonuje losowanie par/grup poszczególnych pucharów. Jeśli chodzi o FM 2006 niewiele się zmieniło... a nawet pogorszyło. Nie wspominam już tutaj przypadków, gdy nagle w jednej grupie Ligi Mistrzów znajdują się takie drużyny jak: Barcelona, Bayern, Man Utd, Juventus, a w następnej Sparta Praga, Fenerbahce, Rosenborg oraz Schalke. Ale jak wytłumaczyć fakt, że wszystkie zespoły z 1 miejsc w swoich grupach P. UEFA, jako przeciwników dostają drużyny, które zajęły 2 miejsca w tych samych grupach? A zespoły z 3 miejsc zostają rozlosowane między sobą? Niestety nie był to jeden przypadek który udało mi się zauważyć, często zdarza się, że trafiają na siebie teamy rozstawione. Jak widać jeszcze dużo jest tutaj do poprawienia, gdyż takie niby błahe błędy skutecznie zniechęcają do gry.