Bardzo wiele zastrzeżeń i dezaprobaty od graczy SI usłyszało za niedopracowanie opcji trenowania piłkarza na nowej dla niego pozycji. Nie ważne jak dobry trening i jak dobre predyspozycje do nowej strony czy też strefy boiska miał gracz – zmiana przez niego pozycji była tylko fikcją programistów, która nijak się miała do rzeczywistości. Po premierze Football Managera 2005, kiedy gracze zwrócili uwagę na braki w tym elemencie gry, Sports Interactive zapowiedziało, że łatka wydana do Managera poprawi ten bug. Niestety, ani pierwsza ani kolejne dwie nie zmieniły nic w tej kwestii. Na szczęście ten problem nie wypadł na stałe z harmonogramu prac programistów z SI Tower – w Football Managerze 2006 prawy obrońca po treningu na prawego pomocnika staje się prawym pomocnikiem dobrej klasy, jeśli miał do tego dobry plan treningowy i predyspozycje. Niestety, sprawdzenie przez graczy tej informacji w Beta demo jest nie możliwe ze względu na ograniczony czas wirtualnej rozgrywki, dlatego pozostaje czekać na wersję finalną w nadziei, że SI po raz kolejny nie zawiedzie graczy.